只要能够在注册登记机关查询到的营业执照，无论是在网上注册登记的，还是在注册登记机关登记的，都是合法的。网上注册的营业执照，也是在注册登记机关的辅助登记系统，进行注册登记的，也需要注册登记系统工作人员进行审核通过后，才可以办理营业执照注册登记，不经过注册登记机关内网系统，营业执照无法注册。因此，网上注册的营业执照是合法的。
免费网上申请营业执照合法吗 扩展
合法的，因为目前办理营业执照是免费的，通常很多代办的机构也是免费帮你办的，你自己去工商局办理也不会很麻烦，在网上也可以申请。不免费的是注册地址，代办机构会收取一定的费用；另外营业执照办下来之后，还会涉及一些记账、报税等工作，代理机构可以帮你做，也是收费的。
